La présence du PNUD à Madagascar est définie par un accord de base avec le gouvernement de Madagascar qui énonce les conditions fondamentales dans lesquelles le PNUD appuiera celui-ci dans la mise en œuvre de ses projets de développement (Document Accord de base de 1992). Les interventions du PNUD Madagascar s’alignent également sur la déclaration de Politique Générale de l’Etat (PGE).

Les priorités stratégiques sont, quant à elles, définies par le Plan Cadre des Nations Unies pour l'Aide au Développement intérimaire (communément appelé UNDAF) qui est ajusté au Plan National pour le Développement afin d'aboutir au Plan d'action du programme pays (CPAP) pour la période 2015-2019.

Débuté en novembre 2014, ce CPAP a été signé par le Gouvernement de Madagascar et le PNUD le 24 février 2015 et constitue le cadre principal de partenariat du PNUD et du gouvernement de Madagascar.

Programme document for Madagascar (2021-2023)

Country programme document Madagascar (2015-2019), extended up to Dec 2020