แผนปฏิบัติการด้านความหลากหลายทางชีวภาพแห่งชาติ (พ.ศ. 2566–2570) ประกอบด้วย 3 ยุทธศาสตร์ และ 12 เป้าหมายหลัก ดังนี้

ยุทธศาสตร์ที่ 1 มุ่งเน้นการเสริมสร้างความเข้มแข็งในการอนุรักษ์ความหลากหลายทางชีวภาพ โดยการยกระดับการจัดการพื้นที่ถิ่นอาศัยและการคุ้มครองชนิดพันธุ์สำคัญ การขยายพื้นที่คุ้มครอง และการพัฒนามาตรการต่าง ๆ เพื่อปกป้องชนิดพันธุ์ที่ใกล้สูญพันธุ์

ยุทธศาสตร์ที่ 2 ส่งเสริมการใช้ประโยชน์จากความหลากหลายทางชีวภาพอย่างยั่งยืนและเป็นธรรม เพื่อให้เกิดประโยชน์แก่ชุมชนท้องถิ่น เช่น การจัดการพื้นที่เกษตร ป่าไม้ การท่องเที่ยว และการประมงอย่างสมดุล ไม่ส่งผลกระทบต่อธรรมชาติ

ยุทธศาสตร์ที่ 3 บูรณาการประเด็นความหลากหลายทางชีวภาพเข้าสู่การกำหนดนโยบายระดับประเทศ ยุทธศาสตร์รายสาขา กระบวนการวางแผน และโครงการพัฒนา โดยเน้นการผลักดันให้ทุกภาคส่วนของการพัฒนามีนโยบายและแผนที่คำนึงถึงความหลากหลายทางชีวภาพอย่างเป็นระบบ